真核生物基因组编码大量的45S rRNA基因，这些45S rRNA基因以串联重复的方式在基因组上分布，组成核仁组织区域（NORs）。拟南芥基因组在2号和4号染色体上臂末端分别有NOR2和NOR4。已有的研究表明NOR2在植物萌发一周以后开始被表观机制沉默。DNA甲基化在45S rRNA基因选择性沉默的过程中起重要作用，但参与该过程的DNA甲基化识别蛋白以及下游的效应蛋白还不清楚。我们的研究鉴定了一个蛋白复合体，并证明该复合体参与45S rRNA基因选择性沉默。该研究首先通过免疫沉淀-质谱联用（IP-MS）技术鉴定到了MBD5和MBD6的两个互作蛋白ACD15.5和ACD21.4，并通过一系列的蛋白互作实验证明MBD和ACD蛋白形成一个大的蛋白复合体。其中MBD5和MBD6是一类DNA甲基化识别蛋白，ACD15.5和ACD21.4属于一类含有α-crystallin结构域的蛋白。研究发现该蛋白复合体的成员都能够发生相分离，同时可以和45S rDNA很好地共定位进而参与调控45S rDNA的表达。

进一步的实验表明MBD-ACD复合体保持完整对于它们的正确定位和正常行使功能都非常重要，同时DNA甲基化和组蛋白乙酰化在调控45S rDNA表达的过程中也起到重要的作用。最后我们通过突变体筛选，发现MBD-ACD复合体能够招募染色质重塑因子MORC6。MORC6位于MBD-ACD的下游被招募到45S rDNA上，通过改变染色质的凝集状态，使得45S rDNA的表达发生了变化。

北京大学现代农业研究院/北京大学现代农学院任志彤博士（现任四川农业大学农学院副教授），北京大学生命科学学院在读博士生勾润宇，已毕业博士生卓婉清和和复旦大学/华南农业大学陈芷郁博士为该论文的共同第一作者，北京大学现代农学院钱伟强研究员为论文的通讯作者。该研究项目得到国家自然科学基金面上项目等基金的支持。