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Nature Communications|小麦广谱抗叶锈病基因Lr47的克隆及其新型短片段易位系的创制

近日,北京大学现代农业研究院陈时盛研究员团队与合作者在国际知名学术期刊Nature Communications上发表了题为“Cloning of the wheat leaf rust resistance gene Lr47 introgressed from Aegilops speltoides”的研究论文,克隆了来自小麦近缘植物拟斯卑尔脱山羊草的广谱抗叶锈病基因Lr47,并创制了新的短片段易位系,促进该基因的育种利用。

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叶锈病是一种世界性的小麦真菌病害,严重威胁小麦的安全生产,可造成严重的小麦产量损失。克隆和利用抗叶锈病基因,培育抗病小麦品种是防治该病害最经济、安全、有效的方法。小麦抗叶锈病基因Lr47来自小麦近缘物种拟斯卑尔脱山羊草,对目前全球主要叶锈菌流行小种具有全生育期、广谱抗病特征,是为数不多的优异抗叶锈病基因。

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图1、Lr47候选基因功能验证:EMS突变体、BSMV-sgRNA诱导的基因编辑、转基因互补实验


本研究利用中国春ph1b突变体诱导部分同源染色体7S/7A的重组配对,开展Lr47基因的精细定位,结合改进的MutRNASeq方法快速获得Lr47的候选基因,该候选基因编码一个典型的CC-NBS-LRR蛋白。利用EMS突变体、BSMV-sgRNA诱导的基因编辑、转基因互补实验,验证了候选基因的功能。随后,开发了Lr47基因的选择性分子标记,并发现Lr47只存在于极少数拟斯卑尔脱山羊草材料中,SNP分析表明该基因来源于Ae. speltoides var. speltoides亚族。根据之前的研究报道,Lr47易位系存在连锁累赘,会导致约3.8%减产,并降低出粉率,增加面粉灰分含量等,限制了该基因的育种应用。本研究获得了~36Mb和~13Mb新型短片段易位系,并通过回交转育到我国主栽品种扬麦21,初步的室内和田间性状评估表明获得的新易位系基本不存在连锁的不利性状。最后,本研究分析了Lr47基因的表达模式、亚细胞定位、是否诱发坏死、自激活活性等相关研究。该研究将促进抗性基因Lr47的育种利用,为小麦抗叶锈病育种提供基因储备和材料基础。

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图2、Lr47短片段易位系的细胞学鉴定及其产量/品种性状评估


北京大学现代农业研究院陈时盛研究员和河北农业大学王逍冬教授为本文的共同通讯作者;北京大学现代农业研究李洪娜华蕾和河北农业大学赵淑清为论文共同第一作者。该研究得到了四川农业大学郝明教授、中国农业大学缑金营教授、华中农业大学茆海亮兰彩霞教授、河北农业大学李在峰教授、北京大学现代农业研究院宋宝兴邓兴旺教授、美国加州大学戴维斯分校Jorge Dubcovsky教授等人的帮助。该研究得到了山东省泰山学者、国家重点研发青年科学家项目、河北省自然科学基金等相关经费的资助。


原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-41833-2


北京大学现代农业研究院是由北京大学与山东省人民政府共同建设的研究性公益二类事业单位,坐落于风景秀丽的潍坊市峡山生态经济开发区,研究院聚焦现代农业重大科学前沿问题,致力于解决“卡脖子”核心关键技术研究,努力打造具有全球影响力的前沿性、引领性、平台性一体的大型综合性研究机构和创新策源地。

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