植物环境信号感知与响应实验室
2024-12-09
实验室、课题组名称：植物环境信号感知与响应实验室
实验室、课题组负责人：
钟上威教授，2003-2007 武汉大学生命科学学院学士；2007-2012 北京大学生命科学学院博士；2010-2012 美国耶鲁大学联合培养博士生；2012-2014 美国耶鲁大学博士后；2014-至今 北京大学生命科学学院研究员，博士生导师；2022-至今 北京大学现代农业研究院 研究员；2024-至今 北京大学 博雅特聘教授、长聘教授。
主要荣誉：国家杰出青年科学基金；国家优秀青年科学基金；国家重点研发计划首席科学家；国家自然科学基金委创新群体， 骨干成员；中国科技协会首批国家“青年人才托举工程”；Monsanto Fellowship award。
现任National Science Review杂志编委；Frontiers in Plant Science杂志编委。
实验室、课题组介绍：
1、研究方向： 大豆种子萌发与幼苗出土存活的分子调控机理；番茄果实发育的分子机制解析与品质改良；药用植物道地性环境成因。
2、主要研究内容：不同土壤环境对植物种子萌发，幼苗生长发育及出土存活的调控机理；
出土过程中多种环境因子与植物内源激素共同调控幼苗形态建成的分子网络；叶绿素合成，叶绿体发育，与幼苗抗光氧化损伤分子机制；植物机械压力感知与应答（植物触觉）的分子信号传导通路。
3、主要研究成果：
1. Zhao Y., Shi H., Pan Y., Lyu M., Yang Z., Kou X., Deng X., Zhong S.*, Sensory circuitry controls cytosolic calcium-mediated phytochrome B phototransduction, Cell, 2023, 186: 1230-1243.
2. Shi H.*, Zhong S.*, Light and temperature perceptions go through a phase separation, Current Opinion in Plant Biology, 2023, 74: 102397. (Invited review)
3. Hwang Y., Han S., Yoo C., Hong L., You C., Le B., Shi H., Zhong S., Hoecker U., Chen X., Chen M.*, Anterograde signaling controls plastid transcription via sigma factors separately from nuclear photosynthesis genes, Nature Communications, 2022, 13: 7440.
4. Chen D., Lyu M., Kou X., Li J., Yang Z., Gao L., Li Y., Fan L., Shi H., Zhong S.*, Integration of light and temperature sensing by liquid-liquid phase separation of phytochrome B, Molecular Cell, 2022, 82: 3015-3029. (Cover story)
团队成员：
团队介绍（人员数量、学历等）：共13人，博士6人，硕士7人。
主要成员介绍：
姓名：常贯晓
职务：副研究员
邮箱：guanxiao.chang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
2007.09-2011.06 河南大学 生物工程 本科
2011.09-2014.06 河南大学 生物化学与分子生物学 硕士
2014.09-2018.06 中国科学院 生物化学与分子生物学 博士
2018.07-2023.06 河南大学 植物学 博士后
工作经历：2023.07-至今，北京大学现代农业研究院，副研究员
研究方向：以地钱及大豆为主要模式植物，研究光敏色素在陆生植物适应性进化中的功能
荣誉：
文章：
Chang Guanxiao, Ma Jianchao, Wang Shuanghua, Tang Mengmeng, Zhang Bo, Ma Yadi, Li Lijuan, Sun Guiling, Dong Shanshan, Liu Yang, Zhou Yun, Hu Xiangyang, Song Chun-Peng,1, Huang Jinling*. Liverwort bHLH transcription factors and the origin of stomata in plants. Current Biology, 2023. (共同第一作者)
Guan Yanlong; Chang Guanxiao; Zhao Jinjie; Wang Qia; Qin Jiali; Tang Mengmeng; Wang Shuanghua; Malan; Ma Jianchao; Sun Guiling; Zhou Yun; Huang Jinling*. Parallel evolution of two AIM24 protein subfamilies and their conserved functions in ER stress tolerance in land plants. Plant Communications, 2022. (共同第一作者)
Ma Jianchao, Wang Shuanghua, Zhu Xiaojing, Sun Guiling, Chang Guanxiao, Li Linglong, Hu Xiangyang, Zhang Shouzhou, Zhou Yun, Song Chun-Peng, Huang Jingling. Major episodes of horizontal gene transfer drove the evolution of land plants. Molecular Plant, 2022. (参与作者：5/11)
Liu Yang, Wang Sibo, …, Chang Guanxiao, …, Zhang Shouzhou et al. The Cycas genome and the early evolution of seed plants. Nature Plants, 2022. (参与作者：12/65）
Chang Guanxiao; Yang Wenjuan; Zhang Qili; Huang Jinling; Yang Yongping; Hu Xiangyang. ABI5-BINDING PROTEIN2 Coordinates CONSTANS to Delay Flowering by Recruiting the Transcriptional Corepressor TPR2. Plant Physiology, 2019. (第一作者)
Chang Guanxiao; Wang Chuntao; Kong Xiangxiang; Chen Qian; Yang Yongping; Hu Xiangyang. AFP2 as the novel regulator breaks high-temperature-induced seeds secondary dormancy through ABI5 and SOM in Arabidopsis thaliana. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2018. (第一作者)
姓名：张丽青
职务：助理研究员
邮箱：liqingzhang1989@163.com
教育背景： 燕山大学 学士 生物制药 2007-2011
河北师范大学 博士 细胞生物学2012-2019
工作经历： 北京大学 博士后 2020-2022
研究方向： 植物光信号感知分子机制研究
荣誉：
文章：
Zhao, J.L., Zhang, L.Q., Liu, N., Xu, S.L., Yue, Z.L., Zhang, L.L., Deng, Z.P., Burlingame, A.L., Sun, D.Y., Wang, Z.Y., Sun, Y., and Zhang, S.W. (2019). Mutual Regulation of Receptor-Like Kinase SIT1 and B'kappa-PP2A Shapes the Early Response of Rice to Salt Stress. Plant Cell 31, 2131-2151. Co-first author (SCI:一区 IF 8.631 Top期刊)
Li-Qing Zhang, Da-Jin Xu, Nan Zhang, Peng Gao, Jun-Wei Zhang, Jian-Hua Zhao, Yong-Feng Han, Ying-Long Chen, Ying Sun, Ji-Long Zhao, Shi-Min Zuo, Sheng-Wei Zhang(2024). Activity-directed selection of natural variants of a receptor kinase facilitates salt-tolerant rice breeding, Plant Physiology, V 194, 618-622.
Li, C.H., Wang, G., Zhao, J.L., Zhang, L.Q., Ai, L.F., Han, Y.F., Sun, D.Y., Zhang, S.W., and Sun, Y. (2014). The Receptor-Like Kinase SIT1 Mediates Salt Sensitivity by Activating MAPK3/6 and Regulating Ethylene Homeostasis in Rice. Plant Cell 26, 2538-2553. (SCI:一区 IF 8.631 Top期刊)
Sun, L.J., Zhang, Q., Wu, J.X., Zhang, L.Q., Jiao, X.W., Zhang, S.W., Zhang, Z.G., Sun, D.Y., Lu, T.G., and Sun, Y. (2014). Two rice authentic histidine phosphotransfer proteins, OsAHP1 and OsAHP2, mediate cytokinin signaling and stress responses in rice. Plant Physiol 165, 335-345. (SCI:二区 IF 6.305)
姓名：向福有
职务：助理研究员
邮箱：fuyou.xiang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：2008年9月-2012年6月，云南师范大学，学士
2012年9月-2015年6月，河南大学，硕士
2015年9月-2022年6月，河南大学，博士
工作经历：2023年4月-至今 北京大学现代农业研究院 助理研究员
研究方向：植物低氧信号转导机制
荣誉：
文章：1. Fuyou Xiang, Wen-Cheng Liu, Xin Liu, Yuwei Song, Yu Zhang, Xiaojing Zhu, Pengtao Wang, Siyi Guo, Chun-Peng Song. (2023). Direct balancing of lipid mobilization and reactive oxygen species production by the epoxidation of fatty acid catalyzed by a cytochrome P450 protein during seed germination. New Phytol. 2023. 237(6): 2104-2117.
2. Huan Dong, Ling Bai, Yu Zhang, Guozeng Zhang, Yanqing Mao, Lulu Min, Fuyou Xiang, Dongdong Qian, Xiaohong Zhu, Chun-Peng Song. (2018). Modulation of guard cell turgor and drought tolerance by a peroxisomal acetate-malate shunt. Mol Plant. 11(10): 1278-1291.
3. Yuwei Song, Fuyou Xiang, Guozeng Zhang, Yuchen Miao, Chen Miao, Chun-Peng Song. (2016). Abscisic acid as an internal integrator of multiple physiological processes modulates leaf senescence onset in Arabidopsis thaliana. Front Plant Sci. 7: 181.
姓名：曾威
职务：助理研究员
邮箱：wei.zeng@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
(1) 2016-09 至 2020-06, 安徽农业大学, 作物生物技术, 博士 导师：李培金
(2) 2013-09 至 2016-06, 安徽农业大学, 作物遗传育种, 硕士 导师：石英尧 朴钟泽（联合培养导师）
工作经历：
(1) 2020-01 至 2020-11, 安徽农业大学, 水稻抗逆分子设计育种创新团队, 科研助理
(2) 2020-11 至 2023-11, 安徽农业大学，水稻抗逆分子设计育种创新团队，博士后，合作导师：黎志康
(3) 2023-05 至 2023-11, 北京大学现代农业研究院，植物环境信号感知与响应实验室，访问学者
(4) 2023-11 至今, 北京大学现代农业研究院，植物环境信号感知与响应实验室，助理研究员
研究方向：大豆乙烯信号感知与适应性机制
荣誉：
第十二届安徽省农林委员会 委员
文章：
(1) Tingting Wen, Xuefei Zhang, Jiaojiao Zhu, Susu Zhang, Mohammad Saidur Rhaman, Wei Zeng*. (2024). A SLAF-based high-density genetic map construction and genetic architecture of thermotolerant traits in maize (zea mays L.). Frontiers in Plant Science, 15: 1338086.
(2) Zeng, Wei; Li, Hua; Zhang, Fanlin; Wang, Xinchen; Rehman, Shamsur; Huang, Shiji; Zhang, Chenyang; Wu, Fengcai; Li, Jianfeng; Lv, Yamei; Zhang, Chaopu; Li, Min; Li, Zhikang; Shi, Yingyao. (2023). Functional characterization and allelic mining of OsGLR genes for potential uses in rice improvement. Frontiers in Plant Science, 14:1236251.
(3) Wei Zeng#; Jian Shi#; Chunhong Qiu#; Yunheng Wang; Shamsur Rehman; Shuaishuai Yu; Shijian Huang; Chen He; Wanyi Wang; Hongyi Chen; Chen Chen; Chuanhong Wang; Zhen Tao; Peijin Li*. (2020). Identification of a genomic region controlling thermotolerance at flowering in maize using a combination of whole genomic re-sequencing and bulked segregant analysis, Theoretical and Applied Genetics, 2020, 133(10): 2797-2810
(4) Shi Y #*, Zeng W#*, Xu M, Li H, Zhang F, Chen Z, Anicet G, Huang S, Huang Y, Wang X, Li J, Zhang X, Zheng Y, Rehman S. (2022). Comprehensive Analysis of Glutamate Receptor-like Genes in Rice (Oryza sativa L.): Genome-Wide Identification, Characteristics, Evolution, Chromatin Accessibility, gcHap Diversity, Population Variation and Expression Analysis. Current Issues in Molecular Biology. 44(12):6404-6427.
(5) Shi, Y #., Zeng, W#., Li, M#., Xiang, C#., Cui, Y.-R., Chen, M.-Y., Liu, H.-Y., Shen, Q., Li, F., Zhang, G.-G., Liang, L.-P., Zhang, F*., Gao, Y.-M*., & Li, Z.-K*. (2022).The power of selection: Dissecting phenotypic plasticity and linkage drag underlying yield traits of rice (Oryza sativa) using selective introgression. Plant Breeding, 141( 4), 513– 532.
(6) Yingyao Shi#, Wei Zeng#, Junping Xie#, Fan Zhang, Dalong Zhuo, Lingling Gao, Mingfu Zhao, Xiaorong Shi, Minghui Xu, Zhenzhen Zheng, Zhiqi Hao, Hongyan Yuan, Zulong Chen, Jun Xiang, Min Li* & Yongli Zhou*. (2022). Marker-assisted introgression of Xa39 improve rice resistance to five Xanthomonas oryzae pv. oryzae strains. Journal of Plant Pathology 104, 801–806.
(7) 石英尧#; 马赛#; 曾威#*; 郝芷圻; 李思敏; 王文生*; 黎珉*（2021），后基因组时代基于选择导入系的水稻设计育种策略, 中国农业科技导报, 2021, 23(11): 25-35.
(8) 曾威#; 白建江#; 张才辉; 杨瑞芳; 方军; 朴钟泽; 石英尧*（2016），水稻氮素利用效率相关性状的动态QTL分析, 江苏农业科学, (04): 110-111.
(9) Wei Zeng; Min Li; Chao Xiang; Yan-ru Cui; Hai-yan Liu; Qian Shen; Fei Li; Fan Zhang; Yong-ming Gao; Ying-yao Shi; Zhi-kang Li ; The power of selection: genetic networks underlying phenotypic plasticity of rice (Oryza sativa L.) yield traits revealed using selective introgression, 第一届全国作物学科博士后学术论坛, 海南三亚, 2020-12-17至2020-12-19 (会议论文)
(10) 文婷婷；张雪飞；郭璇；朱姣姣；Shamsur Rehman；李广贤*；曾威（2024）.水稻谷氨酸受体的低温胁迫响应研究，种子，(02),1-9.
(11) Zhang, C., Li, M., Rey, J. D., Feng, T., Lafitte, R., Zheng, T., Lv, Y., Wu, F., Fu, B., Xu, J., Zhang, F., Zeng, W., Liu, E., Ali, J., Wang, W., & Li, Z*. (2023). Simultaneous improvement and genetic dissection of drought and submergence tolerances in rice (Oryza sativa L.) by selective introgression. Frontiers in plant science, 14, 1134450.
(12) Wang N, Chen H, Qian Y, Liang Z, Zheng G, Xiang J, Feng T, Li M, Zeng W, Bao Y, Liu E, Zhang C, Xu J, Shi Y*. Genome-Wide Association Study of Rice Grain Shape and Chalkiness in a Worldwide Collection of Xian Accessions. Plants. 2023; 12(3):419.
(13) Wang X, Wang W, Tai S, Li M, Gao Q, Hu Z, Hu W, Wu Z, Zhu X, Xie J, Li F, Zhang Z, Zhi L, Zhang F, Ma X, Yang M, Xu J, Li Y, Zhang W, Yang X, Chen Y, Zhao Y, Fu B, Zhao X, Li J, Wang M, Yue Z, Fang X, Zeng W, Yin Y, Zhang G, Xu J, Zhang H, Li ZC*, Li ZK*. Selective and comparative genome architecture of Asian cultivated rice (Oryza sativa L.) attributed to domestication and modern breeding. J Adv Res. 2022 Aug 18:S2090-1232(22)00172-2.
(14) Shi J#, Wang Y#, Wang C#, Wang L, Zeng W, Han G, Qiu C, Wang T, Tao Z, Wang K, Huang S, Yu S, Wang W, Chen H, Chen C, He C, Wang H, Zhu P, Hu Y, Zhang X, Xie C, Lu X, Li P*. Linkage mapping combined with GWAS revealed the genetic structural relationship and candidate genes of maize flowering time-related traits. BMC Plant Biol. 2022 Jul 8; 22(1):328.
(15) Cao Y#, Meng D#, Chen T, Chen Y, Zeng W, Zhang L, Wang Q, Hen W, Abdullah M, Jin Q, Lin Y, Cai Y*. Metacaspase gene family in Rosaceae genomes: Comparative genomic analysis and their expression during pear pollen tube and fruit development. PLoS One. 2019 Feb 22; 14(2):e0211635.
(16) 白建江,朴钟泽,曾威,李刚燮,杨瑞芳*.不同侧根密度对水稻生长发育及主要农艺性状的影响[J].分子植物育种,2019,17(05):1624-1630；
(17) 杨瑞芳,白建江,方军,曾威,李刚燮,朴钟泽*.转基因抗虫水稻秀水134-Bt和非转基因亲本的稻米主要品质性状与淀粉链长分布比较[J].上海农业学报,2017,33(01):31-34；
(18) 杨瑞芳,白建江,方军,曾威,李刚夑,朴钟泽*.转cry1Ac1基因抗虫水稻和非转基因亲本的主要营养成分比较[J].江苏农业科学,2016,44(10):328-330；
(19) 杨瑞芳,白建江,方军,曾威,朴钟泽*,李刚夑*.分子标记辅助选择选育高抗性淀粉水稻新品种[J].核农学报,2015,29(12):2259-2267.
专利：
（1） 曾威，黎珉，石英尧，徐大伟，刘二宝，胡群文，包亚玲，许明慧，王宝琛，黄钰姮，王茜彧，黄世纪. 一种重组自交系群体高密度遗传图谱的构建方法: 公开号：CN113718342A
（2） 黎珉，张兆冬，王莉莉，陈家宏，曾威，袁露露，彭雨欣，姚文政，石英尧. 一种稻-羊-草生态循环农业模式. 公开号：CN113632699A
姓名：李雪
职务：助理研究员
邮箱：xue.li@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
2017.09-2020.06，博士，中山大学，生物化学与分子生物学
2013.09-2016.06，硕士，山东农业大学，生物化学与分子生物学
2008.09-2012.06，本科，内蒙古农业大学，生物技术
工作经历：
2022.5至今，北京大学现代农业研究院植物环境信号感知与响应实验室
2020.06-2022.05，博士后，广州中医药大学
研究方向：植物环境信号感知与响应
荣誉：
文章：
Xue Li, Hongbin Wang and Honglei Jin. Light Signaling-Dependent Regulation of Photosystem II Biogenesis and Functional Maintenance. Plant Physiology. 2020, 183: 1855-1868.
Fenghui Wu, Qinghua Shi, Xiujuan Wang, Zhongtao Sun, Wanying Wang, Xue Li, Liyuan Guo and Jigang Bai. Streptomyces canus GLY-P2 degrades ferulic and p-hydroxybenzoic acids in soil and affects cucumber antioxidant enzyme activity and rhizosphere bacterial community. Plant and Soil. 2019, 436: 71-89.
Yanyan Cao, Mingtao Yang, Xue Li, ...Xiujuan Wang and Jigang Bai. Exogenous sucrose increases chilling tolerance in cucumber seedlings by modulating antioxidant enzyme activity and regulating proline and soluble sugar contents. Scient Horticulturae. 2014, 179: 67-77. (co-first author)
Yanyan Wan, Shuyun Chen, Yawen Huang, Xue Li, Yue Zhang, Xiujuan Wang and Jigang Bai. Caffeic acid pretreatment enhances dehydration tolerance in cucumber seedings by increasing antioxidant enzyme activity and proline and soluble sugar contents. Scient Horticulturae. 2014, 173: 54-64.
Yanyan Wan, Yue Zhang, Lu Zhang, Ziqing Zhou, Xue Li, Qinghua Shi, Xiujuan Wang and Jigang Bai. Caffeic acid protects cucumber against chilling stress by regulating antioxidant enzyme activity and proline and soluble sugar contents. Acta Physiol Plant. 2015, 37: 1706.
Yanyan Cao, Mingtao Yang, Shuyun Chen, Ziqing Zhou, Xue Li, Xiujuan Wang and Jigang Bai. Exogenous sucrose influences antioxidant enzyme activities and reduces lipid peroxidation in water-stressed cucumber leaves. Biologia Plantarum. 2015, 59: 147-153.
专利：
姓名：张思文
职务：科研助理
邮箱：18842538061@sina.cn
教育背景：东北农业大学 作物遗传育种 硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：
荣誉：
文章：
专利：
姓名：陈晓睿
职务：科研助理
邮箱：c2421035678@163.com
教育背景：东北农业大学 农学硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：
荣誉：
文章：
专利：
姓名：仪宁
职务：科研助理
邮箱：yn1051146631@163.com
教育背景：安徽农业大学硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：番茄果实发育
荣誉：
文章：
专利：
姓名：张翠
职务：实验室管理员
邮箱：cui.zhang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：山东农业大学硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：
荣誉：
文章：
专利：
姓名：张苏苏
职务：科研助理
教育背景：吉林农业大学硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：
荣誉：
文章：
专利：
姓名：刘晓丽
职务：科研助理
邮箱：xiaoli.liu@pku-iaas.edu.cn
教育背景：2015.9-2019.7 青岛农业大学 农学专业 本科
2019.9-2022.6 中国农业科学院作物科学研究所 农艺与种业 硕士
工作经历：2022.7-至今 北京大学现代农业研究院
研究方向：大豆幼苗出土
荣誉：
文章：
专利：
姓名：郭晓晓
职务：科研助理
邮箱：1029759656@qq.com
教育背景：潍坊医学院硕士
工作经历：任职北京大学现代农业研究院
研究方向：
荣誉：
文章：
专利：
姓名：毛亚文
职务：访问学者
邮箱：maoyawen16@mails.ucas.ac.cn
教育背景：中国科学院大学博士
工作经历：无
研究方向：豆科植物功能基因研究
荣誉：无
文章：无
专利：无