园艺作物基因组学与生物合成学实验室
实验室、课题组负责人：
郭立（实验室主页：http://www.guo-lab.site/）
实验室、课题组介绍：
1、研究方向：是植物进化基因组与生物信息学、植物天然产物的合成生物学
2、主要研究内容：
(1) 作物基因组学：作物完整基因组破译，作物泛基因组学和多组学分析鉴定作物优良性状基因，指导作物分子设计育种。
(2) 植物基因组进化：植物次生代谢通路的进化机制解析，着丝粒、端粒等暗物质区域的结构、表观遗传和进化机制。
(3) 天然产物合成生物学：植物重要天然产物的生物合成途径解析与异源生物合成。
3、主要研究成果：主导完成多个重要作物的复杂基因组序列的破译，基因组复杂区域着丝粒、端粒的结构解析，揭示关键次生代谢通路的分子基础和进化机制，助力开发天然产物高效生物合成细胞工厂和作物品质改良。
团队成员：
团队介绍（人员数量、学历等）：
主要成员介绍：
姓名：郭立
职务：研究员，课题组长 (Principal Investigator /PI)
邮箱：li.guo@pku-iaas.edu.cn
教育背景：2002年08月-2006年06月，西北农林科技大学，植物保护学，学士（BA）
2006年08月-2012年02月，美国宾夕法尼亚州立大学 (Penn State University) 植物病理学，博士（Ph.D.）
2012年03月-2016年08月，美国马萨诸塞大学 (UMASS) 生物化学与分子生物学系，博士后（Postdoc）
工作经历：2016年09月-2020年06月，西安交通大学，电子与信息学院，副教授 （Associate Professor）
2020年07月-2021年09月，西安交通大学，电子与信息学院，教授，博士生导师 （Professor）
2021年10月-至今，北京大学现代农业研究院，研究员、课题组长（PI）
研究方向：作物基因组学，生物信息学，天然产物合成生物学
荣誉：2023年 山东省自然科学基金“杰出青年”获得者
2022年 山东省“泰山学者”青年专家
2022年 中国科技期刊卓越行动计划优秀审稿人
2021年 潍坊市“鸢都学者”
2020年 国家高层次留学归国人才
代表性论文:
(*共同第一作者; #: 通讯作者)
1. Chen W, Wang J, Chen S, Meng D, Mu Y, Feng H, Zhang L, Guo L#. (2025) Pan-centromere landscape and dynamic evolution in Brassica plants. Nature Plants. https://doi.org/10.1038/s41477-025-02131-5
2. Ayhan DH*, Wang H*, Zhang L*, Wang G, Yi S, Meng D, Xue L, Geng X, Kong Z, Wang X, Wang L, Yang Q, Wang XF, Deng Y, Zhang X, Guo L#. (2025). Gap-free comparative genomics uncover virulence factors in Fusarium wilt of watermelons. PLOS Pathogens. 25;21(8):e1013455.
3. Sun J*, Wang X*, Wang K, Meng D, Mu Y, Zhang L, Wang J, Yao G, Guo L#. (2025) Genomic and epigenomic insight into giga-chromosome architecture and adaptive evolution of royal lily (Lilium regale). Nature Communications. 16, 5617. https://doi.org/10.1038/s41467-025-61289-w
4. Guo L#*, Wang XF*, Ayhan DH*, Rhaman MS*, Yan M*, Jiang J, Wang DY, Zheng W, Mei J, Ji W, Jiao J, Chen SY, Sun J, Yi S, Meng D, Wang J, Bhuiyan MN, Qin GC, Guo LL, Yang QX, Zhang XN, Sun HS, Liu CH, Deng XW, Ye WX#. (2025) Super pangenome of Vitis empowers identification of downy mildew resistance genes for grapevine improvement. Nature Genetics. https://doi.org/10.1038/s41588-025-02111-7
5. Chen W, Yan M, Chen S, Sun J, Wang J, Meng D, Li J, Zhang L, Guo L#. (2024) The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals genetic and epigenetic landscape of centromeres. Nature Plants. https://doi.org/10.1038/s41477-024-01849-y
6. Chen W*, Wang X*, Sun J*, Wang X*, Zhu Z*, Ayhan DH, Yi S, Yan M, Zhang L, Meng T, Mu Y, Li J, Meng D, Bian J, Wang K, Wang L, Chen S, Chen R, Jin J, Li B, Zhang X, Deng XW, He H#, Guo L#. (2024) Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis. Nature Communications. 15, 4295
7. Wang K*, Jin J*, Wang J*, Wang X, Sun J, Meng D, Wang X, Guo L#. (2024 ) The complete telomere-to-telomere genome assembly of lettuce. Plant Communications. https://doi.org/10.1016/j.xplc.2024.101011.
8. Yang B, Meng T, Wang X, Li J, Zhao S, Wang Y, Yi S, Zhou Y, Zhang Y, Li L#, Guo L#. (2024) CAT Bridge: an efficient toolkit for compound-transcript association mining from multi-omics data. GigaScience. https://doi.org/10.1093/gigascience/giae083
9. Wang X*, Li H*, Shen T, Wang X, Yi S, Meng T, Sun J, Wang X, Qu X, Chen S#, Guo L#. (2023) A near-complete genome sequence of einkorn wheat provides insight into the evolution of wheat A subgenomes. Plant Communications. https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100768
10. Liu H, Wang H, Liao XL, Gao B, Lu X, Sun D, Gong W, Zhong J, Zhu H, Pan X, Guo L#, Deng XW#and Zhou Q#. (2022) Mycoviral gene integration converts a plant pathogenic fungus into abiocontrol agent. Proc Natl Acad Sci USA. 119(50): e2214096119
11. Guo L*#, Yao Hui*, Chen W*, Wang X, Ye P, Xu Z, Zhang S,Wu H#. (2022) Natural products of medicinal Plants: biosynthesis and bioengineering in post-genomic era, Horticulture Research. Vol.9: uhac223.
12. Guo L*, Winzer T*, Yang X*, Li Y*, Ning Z*, He Z, Teodor R, Lu Y, Bowser TA, Graham IA#, Ye K#. (2018) The opium poppy genome and morphinan production. Science. 362(6412): p. 343-347.
13. Wang J*, Li J*#, Li Z, Liu B, Zhang L, Guo D, Huang S, Qian W#, Guo L#. (2022) Genomic insights into longan evolution from a chromosome-level genome assembly and population genomics of longan accessions. Horticulture Research. Vol. 9: uhac021.
14. Yang X*, Gao S*, Guo L*, Wang B, Jia Y, Zhou J, Che Y, Jia P, Lin J, Xu T, Sun J, Ye K#. (2021) Three chromosome-scale Papaver genomes reveal punctuated patchwork evolution of the morphinan and noscapine biosynthesis pathway. Nature Communications.12:6030.
15. Guo L, Zhao G, Gao L, Xu JR, Kistler HC, Ma LJ#. (2016) Compartmentalized gene regulatory network of a pathogenic fungus Fusarium graminearum. New Phytologist. 211(2): 527-541.
16. Guo L*, Yu H*, Wang B*, Vescio K, Delulio G, Yang H, Berg A, Zhang L, Edel-Hermann V, Steinberg C, Kistler HC, Ma LJ#. (2021) Metatranscriptomic comparison of endophytic and pathogenic Fusarium-Arabidopsis interactions reveals plant transcriptional plasticity. Molecular Plant-Microbe Interactions. 34(9):1071-1083
17. Wang B, Yu H, Jia Y, Dong Q, Steinberg C, Alabouvette CL, Edel-Hermann V, Kistler HC, Ye K#, Ma LJ#, and Guo L#. (2020) Chromosome-scale genome assembly of strain Fo47, a fungal endophyte and biocontrol agent. Molecular Plant-Microbe Interactions. 33(9):1108-1111
18. Guo L, Breakspear A, Zhao G, Gao L, Kistler HC, Xu JR, Ma LJ#. (2016) Conservation and divergence of the cyclic adenosine monophosphate–protein kinase A (cAMP–PKA) pathway in two plant-pathogenic fungi: Fusarium graminearum and F. verticillioides. Molecular Plant Pathology 17(2): 196-209.
姓名：陈瑞东
邮箱：ruidong.chen@pku-iaas.edu.cn
教育背景：2014年博士毕业于中国科学院大学南海海洋研究所，获得海洋生物学博士学位，博士期间在德国马尔堡大学研修学习。
工作经历：自2015-2022年，先后在江南大学，中国科学院深圳先进技术研究院，天津工业生物技术研究所工作，2022年12月就职于北京大学现代农业研究院，任园艺基因组学与合成生物学课题组副研究员。
研究方向：合成生物学
荣誉：获 2011-2012 年度中国科学院大学“三好学生”奖。
文章：
1. Li F, Chen Q, Deng H, Ye S, Chen R, Keasling JD, Luo X. One-pot selective biosynthesis of Tyrian purple in Escherichia coli. Metab Eng. 2024 Jan;81:100-109.
2.Chen W, Wang X, Sun J, Wang X, Zhu Z, Ayhan DH, Yi S, Yan M, Zhang L, Meng T, Mu Y, Li J, Meng D, Bian J, Wang K, Wang L, Chen S, Chen R, Jin J, Li B, Zhang X, Deng XW, He H, Guo L.Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis.
Nat Commun. 2024 May 20;15(1):4295.
3.Song S, Jiang Y, Chen R, Su W, Liang W, Yang D, Li J, Zhang W, Gao S, Yuan B*, Qu G*, Sun Z*.Whole Cell Biotransformation of Penicillin G by a Three-Enzyme Coexpression System with Engineered Deacetoxycephalosporin C Synthase. Chembiochem. （2022）Jun 3;23(11):e202200179
4. Chen R, Zhang Q, Tan B, Zheng L, Li H, Zhu Y, Zhang C*. Genome Mining and Activationof a Silent PKS/NRPS Gene Cluster Direct the Production of Totopotensamides. Org.Lett., ( 2017), 19 (20), 5697–5700
5.Chen R, Zhang H, Zhang G, Li S, Zhang G, Zhu Y, Liu J, Zhang C*. Characterizing Amosamine Biosynthesis in Amicetin Reveals AmiG as a Reversible Retaining Glycosyl- transferase. J. Am. Chem. Soc., (2013), 135 (33): 12152- 12155.2
6. Chen R, Zhou Z*, Cao Y, Bai Y, Yao B*. High yield expression of an AHL-lactonase from Bacillus sp. B546 in Pichia pastoris and its application to reduce Aeromonas hydrophila mortality in aquaculture. Microb Cell Fact. (2010), 9: 39
7. Fan X, Chen R, Chen L, Liu L*, Enhancement of alpha-ketoglutaric acid production from l-glutamic acid by high-cell-density cultivation. J mol Catal B-Enzym. 126 (2016)10- 17.
8.Wang H, Li Z, Yu X, Chen R, Chen X, Liu L*. Green synthesis of (R)-3-TBDMSO glutaric acid methyl monoester using Novozym 435 in nonaqueous media. RSC Adv. (2015), 5, 75160.
9.Cao Y, Liu,Y, Mao W, Chen R, He S, Gao X, Zhou Z*, Yao B*. Effect of Dietary N-acyl Homoserin Lactonase on the Immune Response and the Gut Microbiota of Zebrafish, Danio rerio, Infected with Aeromonas hydrophila. J world Aquacult SOC.
(2014),2, 149- 162.
10. 樊祥臣，陈瑞东，徐继嗣，刘立明*. L-谷氨酸氧化酶高密度发酵及催化合成 α-酮戊二酸. 过程工程学报. (2016), 16(2) 292-297.
11.靳丛丛，陈修来，陈瑞东，刘立明*.光滑球拟酵母中 AMP 代谢对其生理功能的影响. 微生物学报. (2016), 56(7) 1113- 1122.
12.林钦恒，肖吉，陈瑞东，张长生*. 微生物糖苷类抗生素糖基转移酶的体外研究. 中国抗生素杂志. (2012), 37(12) 881-895.
专 利：
1.罗小舟，黎志波，谢尚波，杰·基斯林，陈瑞东。基因簇表达载体构建的引物设计方法、装置、电子设备CN118136106A
2.张长生，陈瑞东，张庆波，谭彬，郑六眷，李慧贤，朱义广。一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用 CN107794286A
3.刘立明，王元彩，陈修来，陈瑞东，董晓翔，高聪，胡贵鹏，郭亮。一株产 L-苹果酸的酿酒酵母工程菌的构建及应用 CN105400711B
4. 周志刚，姚斌，陈瑞东，曹雅男，何夙旭，黄火清，石鹏君，柏映国。N-酰基高 丝氨酸内酯酶及其生产方法与专用重组菌，ZL200910238630. 1
5. 张长生，张海波，李苏梅，张改云，张光涛，朱义广，陈瑞东，肖吉，鞠建华.友菌素的生物合成基因簇及其应用，ZL201210030835.2
姓名:陈为凯
职务:副研究员
邮箱:weikai.chen@pku-iaas.edu.cn
教育背景:博士研究生
工作经历:2022年3月-至今，北京大学现代农业研究院
研究方向:园艺作物基因组学研究
文章:
[1].Chen W, Wang J, Chen S, Meng D, Mu Y, Feng H, Zhang L, Guo L#. (2025) Pan-centromere landscape and dynamic evolution in Brassica plants. Nature Plants. https://doi.org/10.1038/s41477-025-02131-5
[2]. Chen, W. K., Yan, M., Chen, S. Y., et al. The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals genetic and epigenetic landscape of centromeres. Nature Plants, 2024.
[3]. Chen, W. K#., Wang, X. F#., Sun, J#., et al. Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis. Nature Communications, 2024, 15, 4295.
[4]. Guo, L#., Yao, H#., Chen, W. K#., et al. Natural products of medicinal plants: biosynthesis and bioengineering in post-genomic era. Horticulture Research, 2022, 9, uhac223.
姓名：任晓亮
职务：副研究员
邮箱：xiaoliang.ren@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
2013年-2017年 香港浸会大学 博士研究生
工作经历：
2019年-2024年，中国科学院海洋研究所，副研究员
2025年9月-至今，北京大学现代农业研究院，副研究员
研究方向：园艺作物基因组学
文章：
[1]Xiaoliang Ren, Yanwen Shao, Yiwen Zhang, Ying Ni, Yu Bi, Runsheng Li. Primerdiffer: a python command-line module for large-scale primer design in haplotype genotyping. Bioinformatics, 2023.
[2]Runsheng Li#, Xiaoliang Ren#, Qiutao Ding, Yu Bi, Dongying Xie, Zhongying Zhao. Direct full-length RNA sequencing reveals unexpected transcriptome complexity during Caenorhabditis elegans development. Genome Research, 2020.
[3]Xiaoliang Ren#, Runsheng Li#, Xiaolin Wei#, Yu Bi, Vincy Wing Sze Ho, Qiutao Ding, Zhihong Zhang, Chia-Ling Hsieh, Amanda Young, Jianyang Zeng, Xiao Liu, Zhongying Zhao. Genomic basis of recombination suppression in the hybrid between Caenorhabditis briggsae and C. nigoni. Nucleic Acids Research, 2018.
[4]Runsheng Li#, Xiaoliang Ren#, Yu Bi, Vincy Wing Sze Ho, Chia-Ling Hsieh, Amanda Young, Zhihong Zhang, Tingting Lin, Yanmei Zhao, Long Miao, Peter Sarkies, Zhongying Zhao. Specific Downregulation of Spermatogenesis Genes Targeted by 22G RNAs in Hybrid Sterile Males Associated with an X-Chromosome Introgression. Genome Research, 2016.
# Equal contributor
姓名：王欢
职务：助理研究员
邮箱：huan.wang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
2017年-2021年 西北农林科技大学，植物保护学院，植物病理学专业，博士研究生
2014年-2017年 西北农林科技大学，植物保护学院，植物保护专业，硕士研究生
2009年-2013年 西北农林科技大学，植物保护学院，植物保护专业，本科
工作经历：2021年–至今 北京大学现代农业研究院，助理研究员
研究方向：植物微生物互作；合成生物学
文章：
1. Ayhan DH*, Wang H*, Zhang L*, Wang G, Yi S, Meng D, Xue L, Geng X, Kong Z, Wang X, Wang L, Yang Q, Wang XF, Deng Y, Zhang X, Guo L#. (2025). Gap-free comparative genomics uncover virulence factors in Fusarium wilt of watermelons. PLOS Pathogens. 25;21(8):e1013455.
2. Stage-specific functional relationships between Tub1 and Tub2 beta-tubulins in the wheat scab fungus Fusarium graminearum. Fungal genetics and biology: FG &B 132: 103251.
3. Wang H*, Yao G*, Chen W, Ayhan DH, Wang X, Sun J, Yi S, Meng T, Chen S, Geng X, Meng D, Zhang L#, Guo L#.(2024). a gap-free genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp.conglutinans, a vascular wilt pathogen: Scientific Data. (2024) 11:925 | https://doi.org/10.1038/s41597-024-03763-6
姓名：金京运
职务：助理研究员
邮箱：jingyun.jin@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
学士-天津科技大学 微生物工程专业 2009.9-2013.6
硕士-东京大学 应用生命工学专业（导师：Hiroyuki Horiuchi） 2014.4-2017.3
博士-东京大学 应用生命工学专业（导师：Hiroyuki Horiuchi） 2017.4-2020.3
工作经历：
特任研究员-东京大学 细胞遗传学研究室 （合作导师：Hiroyuki Horiuchi）2020.4-2022.5
助理研究员-北京大学现代农业研究院 2023.2-至今
研究方向：
1. 环境微生物组
利用二代测序（NGS）研究自然环境（如植物、土壤等）中的微生物组组成，同时结合三代测序（PacBio）组装Metagenome Assembled Genome (MAG）及 RNA-seq 数据，通过功能基因组学方法鉴定其中的次级代谢、抗生素耐药和致病相关基因，深入解析环境微生物组对植物抗病性及环境特征的影响及其参与的关键通路。此外，基于 MAG 中鉴定的基因信息，在大肠杆菌、酿酒酵母和米曲霉中进行异源表达，挖掘环境微生物组中新型天然产物，并推动其在医药、农业等领域的产业化转化，以应对我国医药和农业领域的关键问题。
2. 真菌天然产物挖掘
通过真菌的两两共培养，诱导实验室条件下未能生成的次级代谢产物，并对其生成物进行化学成分及对应的次级代谢基因簇鉴定。同时，开展抗癌、抗菌、抗氧化等生物活性鉴定，阐明新型次级代谢产物的特殊生物活性。最终，结合基因簇的高表达及共培养策略，在实验室条件下实现新型次级代谢产物的大量合成，并推动其在医药、农业等领域的应用，解决全球抗生素短缺及农业可持续发展等关键问题。
论文发表：
1. Ke Wang#, Jingyun Jin#, Jingxuan Wang#, Xinrui Wang, Jie Sun, Dian Meng, Xiangfeng Wang, Li Guo*，The complete telomere-to-telomere genome assembly of lettuce, Plant Communications， https://doi.org/10.1016/j.xplc.2024.101011, 2024
2. Weikai Chen, Xiangfeng Wang, Jie Sun, Xinrui Wang, Zhangsheng Zhu, Dilay Hazal Ayhan, Shu Yi, Ming Yan, Lili Zhang, Tan Meng, Yu Mu, Jun Li, Dian Meng, Jianxin Bian, Ke Wang, Lu Wang, Shaoying Chen, Ruidong Chen, Jingyun Jin, Bosheng Li, Xingping Zhang, Xing Wang Deng, Hang He & Li Guo*, Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis, Nature Communications, 15:2495, 2024
3. Jingyun Jin#, Ryo Iwama# & Hiroyuki Horiuchi*, The N-terminal disordered region of ChsB regulates its efficient transport to the hyphal apical surface in Aspergillus nidulans, Current Genetics, 69: 175–188, 2023
4. Jingyun Jin, Ryo Iwama, Keiko Takagi, Hiroyuki Horiuchi*, AP-2 complex contributes to hyphal-tip-localization of a chitin synthase in the filamentous fungus Aspergillus nidulans, Fungal Biology, 125:10, 2021
荣誉：
1. 东京大学生物生产工学中心国际学术会议 优秀奖 2017
姓名：张开金
职务：助理研究员
邮箱：kaijin.zhang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
学士-中国海洋大学食品科学与工程学院（2014-2028，合作导师：孙建安教授）
硕士-中国海洋大学医药学院（2018-2021，导师：李德海教授）
博士-中国海洋大学医药学院（2021-2025，导师：李德海教授）
联培-惠灵顿维多利亚大学（2024，合作导师：Robert Keyzers教授）
研究方向：天然产物生物合成途径与酶学机制解析
荣誉：2023-2024年度中国海洋大学研究生国家奖学金
文章：
(1) Zhang, K.#; Sun, J.#; Song, W.; Liu, J.; Ma, C.; Chen, Y.; Guan, Y.; Liu, Y.; Ren, Z.; Che, Q.; Zhang, G.; Liu, Y.; Zhu, T.; Li, D. Multifunctional Cytochrome P450 Orchestrates Radical Cleavage and Non-Radical Cyclization in 5-Oxaindolizidine Biosynthesis. Chem. Sci. 2025,16, 10563-10571.
(2) Zhang, K.#; Liu, J.#; Jiang, Y.#; Sun, S.; Wang, R.; Sun, J.; Ma, C.; Chen, Y.; Wang, W.; Hou, X.; Zhu, T.; Zhang, G.; Che, Q.; Keyzers, R. A.; Liu, M.; Li, D. Sorbremnoids A and B: NLRP3 Inflammasome Inhibitors Discovered from Spatially Restricted Crosstalk of Biosynthetic Pathways. J. Am. Chem. Soc. 2024, 146 (26), 18172–18183.
(3) Zhang, K.#; Zhang, G.#; Hou, X.; Ma, C.; Liu, J.; Che, Q.; Zhu, T.; Li, D. A Fungal Promiscuous UbiA Prenyltransferase Expands the Structural Diversity of Chrodrimanin-Type Meroterpenoids. Org. Lett. 2022, 24 (10), 2025–2029.
(4) Ma, C.#; Zhang, K.#; Zhang, X.; Liu, G.; Zhu, T.; Che, Q.; Li, D.; Zhang, G. Heterologous Expression and Metabolic Engineering Tools for Improving Terpenoids Production. Curr. Opin. Biotechnol. 2021, 69, 281–289.
(5) Ma, C.#; Wang, W.#; Zhang, K.; Zhang, F.; Chang, Y.; Sun, C.; Che, Q.; Zhu, T.; Zhang, G.; Li, D. Exploring the Diverse Landscape of Fungal Cytochrome P450‐Catalyzed Regio‐ and Stereoselective Dimerization of Diketopiperazines. Adv. Sci. 2024, 11 (26), 2310018.
(6) Wang, Q.; Zhang, K.; Wang, W.; Zhang, G.; Zhu, T.; Che, Q.; Gu, Q.; Li, D. Amphiepicoccins A–J: Epipolythiodioxopiperazines from the Fish-Gill-Derived Fungus Epicoccum Nigrum HDN17-88. J. Nat. Prod. 2020, 83 (2), 524–531.
(7) Xu, H.; Zhang, X.; Zhang, Y.; Liu, G.; Chen, Y.; Hou, X.; Liu, X.; Zhang, K.; Ma, C.; Feng, R.; Shen, J.; Pfeifer, B. A.; Che, Q.; Zhu, T.; Zhang, G. Nucleophilic Addition Promoted Ring Rearrangement-Aromatization in Aza-/Thio-Sesquiterpenoid Biosynthesis. Nat. Commun. 2025, 16 (1), 7369.
(8) Zhu, Y.#; Zhang, X.#; Ma, C.; Ren, X.; Wang, W.; Zhang, K.; Zhang, G.; Che, Q.; Zhu, T.; Li, D. Discovery and Characterization of a Fungal N-Acetylglucosamine Transferase in the Biosynthesis of Furanone Glycosides. J. Nat. Prod. 2025, 88 (2), 427–432.
(9) Wang, L.; Zhang, X.; Zhang, K.; Zhang, X.; Zhu, T.; Che, Q.; Zhang, G.; Li, D. Overexpression of Global Regulator PbrlaeA Leads to the Discovery of New Polyketide in Fungus Penicillium Brocae HDN-12-143. Front. Chem. 2020, 8, 270
姓名：李君
职务：科研助理
邮箱：jun.li@pku-iaas.edu.cn
教育背景：硕士研究生
工作经历：2021年11月-至今 北京大学现代农业研究院
研究方向：天然产物的检测与鉴定
姓名：王祥锋
职务：科研助理
邮箱：xiangfeng.wang@pku-iaas.edu.cn
教育背景：硕士研究生
工作经历：2022年6月-至今 北京大学现代农业研究院
研究方向：植物基因组学、植物系统进化
文章：
*: Co-first author
1.Guo L#*, Wang X*, Ayhan DH*, Mohammad SR*, Yan M*, Jiang J, Wang D, Zheng W, Mei J, Ji W, Jiao J, Chen S, Sun J, Yi S, Meng D, Wang J, Mohammad NB, Qin G, Guo LL, Yang Q, Zhang X, Sun H, Liu C, Ye W#. (2024) Super pangenome of Vitis empowers identification of downy mildew resistance genes for grapevine improvement. Nature Genetics. In Press.
2.Weikai Chen*, Xiangfeng Wang*, Jie Sun*, Xinrui Wang*, Zhangsheng Zhu*, et al. Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis, Nature Communications 15, 4295 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-48643-0
3.Qiao Wang*, Xiangfeng Wang*, et al. An integrated system of Pleurotus pulmonarius and Protaetia brevitarsis larvae promotes the efficient and high-value utilization of lignocellulosic biomass. Waste and Biomass Valorization 14, 277-286 (2023). https://doi.org/10.1007/s12649-022 01872-0.
4.Xiangfeng Wang*, Hongna Li*, et al. A near-complete genome sequence of einkorn wheat provides insight into the evolution of wheat A subgenomes. Plant Communications (2023). https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100768.
姓名：孙杰
职务：Research Assistant
教育背景：M.A. of Yunnan University
工作经历：2022-Present, PKU-IAAS
研究方向：3D genomics and epigenomics
文章：
1.Sun J*, Wang X*, Wang K, Meng D, Mu Y, Zhang L, Wang J, Yao G, Guo L#. (2025) Genomic and epigenomic insight into giga-chromosome architecture and adaptive evolution of royal lily (Lilium regale). Nature Communications. 16, 5617. https://doi.org/10.1038/s41467-025-61289-w
2.Chen W, Wang X, Sun J (Co-fisrt author), Wang X, Zhu Z, Ayhan DH, Yi S, Yan M, Zhang L, Meng T, Mu Y, Li J, Meng D, Bian J, Wang K, Wang L, Chen S, Chen R, Jin J, Li B, Zhang X, Deng XW, He H, Guo L. Two telomere-to-telomere gapless genomes reveal insights into Capsicum evolution and capsaicinoid biosynthesis. Nat Commun. 2024 May 20;15(1):4295.
姓名：丁锐
职务：科研助理
邮箱：rui.ding@pku-iaas.edu.cn
教育背景：
2021年-2024年 郑州大学，农学院，生物与医药专业，硕士研究生
2017年-2021年 江南大学，食品学院，食品科学与工程专业，学士
工作经历：2025年3月-至今 北京大学现代农业研究院
研究方向：天然产物的合成
姓名：李蕊
职务：科研助理
邮箱：liruimyp@163.com
教育背景：
2017年-2021年 吉林农业大学，资源与环境学院，农业资源与环境专业，本科
2022年-2025年 北京农学院，植物科学技术学院，园艺学专业，硕士研究生
工作经历：2025年6月-至今 北京大学现代农业研究院
研究方向：植物基因组学
荣誉称号：北京市优秀毕业生、研究生国家奖学金
论文发表：
Rui Li, Zhenglin Li*, Kui Zhang, Cong Zhang, Yue Sun, Jie Zhang, Yi Zheng, Yuncong Yao, Xiaoxiao Qin*. The responses of root exudates and microbiome in the rhizosphere of main plant and aromatic intercrops to soil Cr stress, Environmental Pollution, Volume 366, 2025, 125528, ISSN 0269-7491. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2024.125528.
姓名：孟芮
职务：科研助理
邮箱：rui.meng@pku-iaas.edu.cn
教育背景：2021.09- 2024.06 南京农业大学 植物病理学专业 硕士研究生
2017.09- 2021.06 山东农业大学 烟草专业 本科
工作经历：2025.09- 至今 北京大学现代农业研究院，科研助理
研究方向：天然产物生物合成
姓名：石金娟
职务：联培学生
邮箱：2098256737@qq.com
教育背景：硕士在读
姓名：冯娜娜
职务：联培学生
邮箱：3165153304@qq.com
教育背景：硕士在读
实验室配备的大型仪器设备
欢迎广大科研人员预约使用！
仪器所在位置：北京大学现代农业研究院郭立实验室（C215)，负责人：郭立研究员。管理员：李君，预约电话：18353680676
